Вдоль реки, по всей её длине тянется Чуйский тракт. Бассейн реки Сема ограничен: с запада - бассейном реки Песчаная, с востока бассейном реки Катунь. С восточной стороны реки тянется Семинский хребет.
Река Сема течет через административный центр Шебалинского района - село Шебалино. А также река протекает через сёла - Камлак, Черга, Мыюта, Кумалыр, Топучая. В долине реки расположены: село Актел, Малая Черга, Дьектиек.
Сема имеет множество притоков. Недалеко от истока в Сему впадает правый приток - река Сарлык, которая стекает со склонов одноименной горы.
Правые притоки реки Сема (от истока к устью): Река Верх.Кумалыр, Ниж.Кумалыр, Седлушка, Покатайка, Кислая, Марчела, Черная Мыюта, Крешта, Актел, Шергаил, Едрала, Сосновая. Левые притоки (от истока к устью): река Топучка, Кысмаин, Куяхтанар, Гордуба, Арбайта, Чергушка, Барсуган, Куюла, Акташ, Улус-Черга, Актел.
В долине реки Сема расположено урочище Орешная Яма, Тимошкин лог, Артемьев лог, лог Большой Катаил, Курносов лог.
Дисциплина "Слалом" на реке Сема
Река Сема является одним из полигонов для подготовки спортсменов по гребному слалому и рафтингу. На этой реке проходят соревнования по этим видам спорта.
В.Я. Шишков в начале XX века, описывает Чике-Таманский перевал: "Чике-Таман. Прежде всего изречение, нацарапанное на придорожном столбе, на самой вершине перевала рукою отчаявшегося ямщика: "Ета не Чике-Таман, а Черт-Атаман, сорок восемь грехов"
