Река Чебдар берет свое начало на восточном склоне Сумультинского хребта на границе Онгудайского и Улаганского районов Республики Алтай на высоте около 2500 метров. Чебдар почти на всем своем протяжении находится в ущелье, высота стен каньона которого местами доходит до 100 метров. На рельефной карте корошо видна глубина каньона реки (обведена красным цветом):
Сначала Чебдар течет с севера на юг между хребтов Сумультинский и Тонгош, ближе к середине постепенно поворачивает на восток.
Чебдар впадает в Башкаус в 10 километрах от устья Башкауса. В устье Чебдара есть дорога. Выше по Чебдару пройти проблематичено даже пешком. В устье хорошо видно, как изумрудно-зеленая вода Чебдара сливается с мутной водой Башкауса, долго не перемешиваясь. В устье над Чебдаром есть неплохая смотровая площадка, до которой подниматься вверх по склону 15-20 минут, переваливая высокую скальную гриву. С этой площадки открывается панорама ущелий Чебдара и Башкауса.
В месте впадения Чебдара в Башкаус хорошо ловиться хариус, в окрестностях много земляники и грибов.
От устья Чебдара есть тропа, которая сначала ведет по каньону Чебдара, а затем крутым серпантином поднимается в долину реки Чага, открывая панораму Чебдарского ущелья, долин рек Башкаус и Чулышман.
Устье Чебдара (справа)
Подавляющая часть ущелья реки Чебдар поросла лесами. Преобладающими породами здесь являются кедр и лиственница.
В Чебдар впадает масса мелких и несколько более крупных рек. Наиболее крупными притоками являются Уйкараташ, Тайтыйн, Сынырлу, Караган.
Пазырыкская культура хронологически относится к железному веку, основные находки предметов сделаны непосредственно в алтайских горах. Носители этой культуры обитали на смежных территориях Казахстана, Республики Алтай и Монголии. Основным занятием кочевого населения была охота и скотоводство