Берега озера Хотон-Нур довольно извилисты. Главный массив Монгольского Алтая, протянувшийся параллельно юго-западному берегу, спускается к прибрежной низине крутыми, снизу лесистыми, а выше безлесными склонами. Лес исключительно лиственничный. В хребте напротив озера есть пять ущелий, в глубине которых возвышаются снежные вершины. Из них вытекают правые притоки озера. Два нижних незначительны. Против середины озера из двух ущелий выходит Дзагаст-Гол (дзагаст – «рыба»; абак-кереи эту реку называют Сагыстей, Сегистей). Пятое ущелье дает речку Элэгтийн-Гол (абак-кереи ее знают под именем Эльдык), в 4 км от Дзагаст-Гол. В верхнее изголовье озера впадают две более крупных реки. Это Хара-Салагийн-Гол (хара – «черный»; салагийн – «протока, рукав реки»; по-казахски Каратыр, или Черная Кобдо) и Цаган-Ус (по-казахски Аксу, или Белая Кобдо).
| 
